Posláním Centra projektů PEF (CP PEF) je podpora kvality řešení národních a mezinárodních projektů, poskytování standardizovaných i speciálních podkladů pro řízení a rozhodování managementu fakulty i univerzity, dále prezentace informací o projektech a výsledcích řešení úspěšných projektů uvnitř i vně fakulty ve formě konzistentní i aktivní prezentace.
CP PEF metodicky navazuje v rámci managementu univerzity svým posláním a činností na Centrum projektů rektorátu ČZU se kterým aktivně spolupracuje.
Základní oblasti činnosti CP PEF
- organizace realizačních týmů, směřující k týmové spolupráci kateder, případně i fakult, k posílení účasti mladých pracovníků v projektech
 - shromažďování potenciálních témat projektů na pracovištích
 - vytipování řešitelských kolektivů složených z různých kateder a motivace k jejich účasti na řešení projektů
 - konzultace ideových záměrů projektů s cílem odstranit duplicity a využít synergický efekt spolupráce kateder
 - metodická podpora při přípravě projektů
 - podpora rutinních administrativních činností s cílem uvolnit prostor pro vlastní odbornou činnost
 - vytváření komplexních podkladů o projektech, konsorciích, výsledcích projektů pro vedení fakulty
 - podpora při vyhledávání zahraničních partnerů, uzavírání smluv se zahraničními partnery, zajišťování právních dokumentů od zahraničních partnerů
 - příprava dohod o financování vlastní spoluúčasti z fakultních zdrojů, finančního pokrytí překlenovacích období mezi platbami, zajištění finančních rezerv pro případ ztrát
 - příprava a organizace mezinárodních seminářů a setkání řešitelů, pomoc při provádění standardních diseminačních činností, podpora post-projektových činností
 - analýza neúspěšných projektů, identifikace příčin neúspěchu